儿童糖尿病的治疗，首选药物控制病情，再结合饮食和运动调理。Ⅰ型糖尿病只有终身选择胰岛素，而Ⅱ型糖尿病则可选择胰岛素或口服降糖药。《中国糖尿病防治指南》指出，对儿童和青少年Ⅱ型糖尿病口服降糖药的选择及应用基本同成人一样，但绝大多数的口服降糖药物却未在儿童和青少年中做全面系统的安全性研究，因此，许多口服降糖药物说明书中都不推荐或禁用于儿童和青少年。
口服药首选二甲双胍：用于治疗儿童青少年2型糖尿病的药物非常有限，二甲双胍是第一个获得美国国家食品药品监督管理局（FDA）批准用于治疗儿童青少年2型糖尿病的口服降糖药。二甲双胍临床使用多年，是对儿童青少年2型糖尿病安全有效的降糖药，它的安全性和有效性得到了全世界医疗领域和患者的公认，是治疗2型儿童青少年糖尿病首选的口服降糖药物，尤其在治疗肥胖型糖尿病患者中疗效显着。
二甲双胍在儿童青少年2型糖尿病中是按剂量计算使用的，这和通常儿童用药按体重计算用量有所不同。儿童青少年2型患者使用的合适剂量是从小剂量开始，根据病人的个体情况，逐渐增加剂量。开始的剂量是每次250毫克，每日2次服用，持续一周，观察病情，若没有好转，可加大剂量，至500-850毫克/次；对于体重50kg以上的儿童患者，刚开始的剂量也可使用成人推荐剂量500毫克/次，每日2次。儿童青少年2型糖尿病患者若伴有高血糖（血糖值＞13.9mmol/l）或有酮症，应考虑胰岛素治疗，待血糖稳定后，再换用口服降糖药。
胰岛素：胰岛素是治疗1型儿童青少年糖尿病的首选药物，特别是在急性糖代谢失调，长期高血糖产生高糖毒性，导致周围组织胰岛素抵抗或患儿糖尿病分型有困难时，宜选用胰岛素，以达到比较理想的治疗效果。
磺脲类药物：这类药物并非治疗儿童糖尿病的首选。磺脲类药物最严重的副作用是会产生低血糖，由于儿童处于生长发育期，低血糖对大脑发育有显着的影响，目前建议空腹血糖控制在4-6mmol/L，糖化血红蛋白的水平控制在6.5%-7.0%，对于5岁以下的儿童，这个标准可适当放宽，以防低血糖的发生。
糖苷酶抑制剂：这类药物对糖尿病能起到一定预防作用，而且服用后此类药物不会对儿童肠胃道造成明显不良反应。但这类药物使用较少，但研究显示此类药物安全性较好，可以放心使用。
